Die Europäische Gesellschaft für Psychotherapie (EAP) anerkennt die NLP-Psychotherapie als gleichwertige Methode zu Verhaltenstherapie und Psychoanalyse. Daher hat sich NLP in diesem Bereich bereits fix etabliert. So verfügt NLP über etliche wirksame Verfahren, die bei einer Vielzahl klinisch relevanter Erscheinungsbilder eingesetzt werden können. Besonders was die Behandlung von Phobien betrifft, werden hier beachtliche Ergebnisse innerhalb kürzester Zeit erreicht.